به گزارش ایلنا، متن پیام حجت‌الاسلام و المسلمین محمد خاتمی به شرح زیر است:
«درگذشت تأسف‌انگیز انسانی شریف و خیراندیش و کاردان و کارآفرین، جناب آقای مهندس محسن خلیلی را که خدمات ارزنده‌ای به ایران و ایرانی، به ویژه در عرصه اقتصاد و تولید کرده است به همه اصحاب خیر و خدمت و بخصوص به انبوه یاران و دوستان و ارادتمندان آن بزرگوار و بالاخص به خاندان شریف خلیلی و بستگان سببی و نسبی ایشان تسلیت می‌گویم و از خداوند منان برای این فقید سعید آمرزش و رحمت و برای بازماندگان معزز تندرستی، شکیبایی و پاداش نیکو مسألت می‌کنم.»