پس از جدا شدن امیر قلعه‌نویی از استقلال که خرداد سال ۱۳۸۸ به وقوع پیوست، رابطه او با آشتیانی بسیار سرد شد و طرفین هرازگاهی با یکدیگر جدل می‌کردند.
استقلال: گرگ‌ها در کمین هستند
در همین رابطه باشگاه استقلال بیانیه‌ای منتشر کرد که ۲۷ مهر سال ۱۳۸۸ آن را منتشر کردیم. استقلالی‌ها در این بیانیه مدعی شده بودند برخی افراد که منافع خود را در جمع آبی‌پوشان از دست داده‌اند، مروج لمپنیسم هستند و واکنش‌هایی همراه با حسادت و عصبانیت از خود نشان می‌دهند چون دیگر جایی در خانه استقلال ندارند. همچنین در بخش دیگری از این بیانیه با کنایه بر عبارات وایرال‌شده امیر قلعه‌نویی نظیر پازل تاکتیکی و روزهای فیفادی، از این جمله نیز یاد شد که گرگ‌هایی در کمین استقلال نشسته‌اند.
قلعه‌نویی:شما دروغگو هستید
بیانیه باشگاه استقلال واکنش تند امیر قلعه‌نویی را در همان ۲۷ مهر ۱۳۸۸ در پی داشت و او حرف‌هایی زد که بهتر است خودتان آن‌ها را دنبال کنید:
- آقایان گفتند گرگ‌هایی در کمین نشسته‌اند ولی نگفتند اگر من گرگ بودم، چرا به دنبال این بودید که قراردادم در استقلال را تمدید کنید؟ آقایان دروغگو هستند و حافظه هم ندارند.
- بیانیه‌های متعدد باشگاه استقلال نشان می‌دهد آن‌ها می‌خواهند برنامه‌ریزی غلط و نتایج نامناسب خود را تحت الشعاع قرار بدهند وگرنه چه دلیلی دارد به من حمله کنند؟
- مدیران استقلال مدعی‌اند ریشه باشگاه استقلال را پاک کرده‌اند ولی دو بازیکن این تیم به مدت ۱۵ دقیقه داخل اتوبوس با یکدیگر کتک‌کاری می‌کنند و سرمربی استقلال هم کت خود را در می‌آورد و به میان تماشاگران می‌رود (کنایه به جر و بحث شدید صمد مرفاوی، سرمربی وقت استقلال با تماشاگران پاس همدان در مهر ۱۳۸۸)
- واقعا خنده‌دار است. این‌همه بداخلاقی در استقلال وجود دارد اما بازهم به من می‌گویند لمپن! آقایانی که چنین حرف‌هایی می‌زنند، دروغگوهای خوبی هستند که هنوز نتوانستند محبوبیتی در استقلال کسب کنند.